Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A1Q8WWI5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms