Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL3Q8N8U3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms