Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NHLRC3Q5JS37 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms