Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms