Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NID2Q14112 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NID2Q14112 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NID2Q14112 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NID2Q14112 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NID2Q14112 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NID2Q14112 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NID2Q14112 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NID2Q14112 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NID2Q14112 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NID2Q14112 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NID2Q14112 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NID2Q14112 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NID2Q14112 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NID2Q14112 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NID2Q14112 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NID2Q14112 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NID2Q14112 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NID2Q14112 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NID2Q14112 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NID2Q14112 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NID2Q14112 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NID2Q14112 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NID2Q14112 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NID2Q14112 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NID2Q14112 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NID2Q14112 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NID2Q14112 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NID2Q14112 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NID2Q14112 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NID2Q14112 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NID2Q14112 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NID2Q14112 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NID2Q14112 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NID2Q14112 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NID2Q14112 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NID2Q14112 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NID2Q14112 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NID2Q14112 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NID2Q14112 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NID2Q14112 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NID2Q14112 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NID2Q14112 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NID2Q14112 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NID2Q14112 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NID2Q14112 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NID2Q14112 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NID2Q14112 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NID2Q14112 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NID2Q14112 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NID2Q14112 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NID2Q14112 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NID2Q14112 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NID2Q14112 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NID2Q14112 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NID2Q14112 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NID2Q14112 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NID2Q14112 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NID2Q14112 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NID2Q14112 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NID2Q14112 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NID2Q14112 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NID2Q14112 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NID2Q14112 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NID2Q14112 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NID2Q14112 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NID2Q14112 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NID2Q14112 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NID2Q14112 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NID2Q14112 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NID2Q14112 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NID2Q14112 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NID2Q14112 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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