Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SHROOM2Q13796 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SHROOM2Q13796 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms