Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 MRPL32YCR003W 552 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 PEX19YDL065C 1029 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 SCL1YGL011C 759 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 ARI1YGL157W 1044 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 CAX4YGR036C 720 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YHR214WYHR214W 612 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YIL028WYIL028W 399 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YAR066WYAR066W 612 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 SAP30YMR263W 606 nt4.77□□□□□ -1.65 RIP-Chip
PUF2Q12221 IMD3YLR432W 1572 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 APL6YGR261C 2430 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 FPK1YNR047W 2682 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YMR196WYMR196W 3267 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 SYP1YCR030C 2613 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 PAD1YDR538W 729 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 BUD16YEL029C 939 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 HAT2YEL056W 1206 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YER187WYER187W 426 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 DSD1YGL196W 1287 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 KAR2YJL034W 2049 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 LIP2YLR239C 987 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 AIF1YNR074C 1137 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YSA1YBR111C 696 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 SUM1YDR310C 3189 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 TOS3YGL179C 1683 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 MCM4YPR019W 2802 nt4.76□□□□□ -1.65 RIP-Chip
PUF2Q12221 TFG1YGR186W 2208 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YEH2YLR020C 1617 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 PCL8YPL219W 1479 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 ABD1YBR236C 1311 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YCR016WYCR016W 873 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 ARF2YDL137W 546 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YEL067CYEL067C 588 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 PAU17YLL025W 375 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 CSR1YLR380W 1227 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YNL134CYNL134C 1131 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 PPG1YNR032W 1107 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 VPS68YOL129W 555 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 NRG2YBR066C 663 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 SAF1YBR280C 1914 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 STE7YDL159W 1548 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 HIR2YOR038C 2628 nt4.75□□□□□ -1.65 RIP-Chip
PUF2Q12221 RTC5YOR118W 1704 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 DEG1YFL001W 1329 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 TDA6YPR157W 1404 nt4.74□□□□□ -1.65 RIP-Chip
PUF2Q12221 ENT5YDR153C 1236 nt4.74□□□□□ -1.65 RIP-Chip
PUF2Q12221 RRP17YDR412W 708 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YDR445CYDR445C 408 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YER084WYER084W 387 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 SUT1YGL162W 900 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 ECT1YGR007W 972 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 snR189snR189 189 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 SLM4YBR077C 489 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 UMP1YBR173C 447 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 snR3snR3 194 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 SEC9YGR009C 1956 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 RVB1YDR190C 1392 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YGR122WYGR122W 1209 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YHR054CYHR054C 1065 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 DCD1YHR144C 939 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 DCG1YIR030C 735 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YKL023WYKL023W 834 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YLL047WYLL047W 384 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 PSY3YLR376C 729 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 SNO1YMR095C 675 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 APM2YHL019C 1818 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 MAG2YLR427W 2013 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 FRE3YOR381W 2136 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 TUB3YML124C 1338 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 ERG4YGL012W 1422 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YHR182WYHR182W 2358 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 SSB2YNL209W 1842 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 IFM1YOL023W 2031 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YFT2YDR319C 825 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 CAF16YFL028C 870 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YNL303WYNL303W 348 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 GSP2YOR185C 663 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 TFB6YOR352W 1032 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 RMI1YPL024W 726 nt4.72□□□□□ -1.65 RIP-Chip
PUF2Q12221 SMA1YPL027W 738 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 ANT1YPR128C 987 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 YCL012CYCL012C 405 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 DNF2YDR093W 4839 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 FRS1YLR060W 1788 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 RRP14YKL082C 1305 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 IBA57YJR122W 1494 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YDL012CYDL012C 324 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 PCL2YDL127W 927 nt4.71□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 GLE2YER107C 1098 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YJR012CYJR012C 624 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YIM2YMR151W 438 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 MER1YNL210W 813 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 SSU72YNL222W 621 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 PRM4YPL156C 855 nt4.71□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPR015CYPR015C 744 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 HXT7YDR342C 1713 nt4.71□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 HXT6YDR343C 1713 nt4.71□□□□□ -1.66 RIP-Chip
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