Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 APS3YJL024C 585 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 RPS31YLR167W 459 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YAR061WYAR061W 204 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 RPN13YLR421C 471 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 POP8YBL018C 402 nt6.01□□□□□ -1.45 RIP-Chip
PUF3Q07807 SEN15YMR059W 387 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 SNZ2YNL333W 897 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YPL034WYPL034W 498 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 RPS9AYPL081W 594 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 FKH1YIL131C 1455 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 SMF2YHR050W 1650 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 AVT2YEL064C 1443 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 DFM1YDR411C 1026 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 LRS4YDR439W 1044 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YGR114CYGR114C 390 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 RRP4YHR069C 1080 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 GAB1YLR459W 1185 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 PML39YML107C 1005 nt6□□□□□ -1.45 RIP-Chip
PUF3Q07807 SEC14YMR079W 915 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 PFA3YNL326C 1011 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 SER1YOR184W 1188 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 HUT1YPL244C 1020 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 MLC2YPR188C 492 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 GRX1YCL035C 333 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 FAT3YKL187C 2253 nt6□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 MRK1YDL079C 1506 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 ATR1YML116W 1629 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 MTC5YDR128W 3447 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 ATO3YDR384C 828 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 TLG1YDR468C 675 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 RSM28YDR494W 1086 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 PRS2YER099C 957 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 EMC4YGL231C 573 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 RSM27YGR215W 333 nt5.99□□□□□ -1.45 RIP-Chip
PUF3Q07807 RPC17YJL011C 486 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YLR126CYLR126C 756 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YMR085WYMR085W 1299 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YNR061CYNR061C 660 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 MUP3YHL036W 1641 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 HIR1YBL008W 2523 nt5.98□□□□□ -1.45 RIP-Chip
PUF3Q07807 SET5YHR207C 1581 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 QNS1YHR074W 2145 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 GEX1YCL073C 1848 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YDL172CYDL172C 480 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 TAN1YGL232W 870 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YIM1YMR152W 1098 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YNL013CYNL013C 378 nt5.98□□□□□ -1.45 RIP-Chip
PUF3Q07807 SCO1YBR037C 888 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 MRP51YPL118W 1035 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 DIM1YPL266W 957 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YBR219CYBR219C 384 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 HSF1YGL073W 2502 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 ISN1YOR155C 1353 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 SNU23YDL098C 585 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 URA3YEL021W 804 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 GIC1YHR061C 945 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 PEX18YHR160C 852 nt5.97□□□□□ -1.45 RIP-Chip
PUF3Q07807 BET4YJL031C 984 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YLR317WYLR317W 435 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YML099W-AYML099W-A 330 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YNL143CYNL143C 393 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 MVD1YNR043W 1191 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 UFE1YOR075W 1041 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 RRG8YPR116W 834 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 TFG1YGR186W 2208 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 QDR3YBR043C 2070 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YCR001WYCR001W 315 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 DAS2YDR020C 699 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 IPK1YDR315C 846 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 SOH1YGL127C 384 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YGL138CYGL138C 1038 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 LNP1YHR192W 837 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YIL163CYIL163C 354 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 DAN1YJR150C 897 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 RNP1YLL046C 750 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 RAD10YML095C 633 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YNL108CYNL108C 813 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YBR287WYBR287W 1284 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 ERT1YBR239C 1590 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YLR446WYLR446W 1302 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 RUD3YOR216C 1455 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 BCS1YDR375C 1371 nt5.95□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF3Q07807 SMP1YBR182C 1359 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 SPS2YDR522C 1509 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 PRR2YDL214C 2100 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 CAF16YFL028C 870 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YGL072CYGL072C 360 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YGR226CYGR226C 210 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 LIN1YHR156C 1023 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 CAB2YIL083C 1098 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 APQ13YJL075C 417 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 KRE9YJL174W 831 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YKL031WYKL031W 414 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YKL115CYKL115C 393 nt5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.6 ms