Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms