Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP1P59025 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP1P59025 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP1P59025 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP1P59025 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP1P59025 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP1P59025 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP1P59025 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP1P59025 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP1P59025 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP1P59025 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP1P59025 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP1P59025 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP1P59025 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP1P59025 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP1P59025 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP1P59025 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP1P59025 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP1P59025 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP1P59025 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP1P59025 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP1P59025 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP1P59025 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP1P59025 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP1P59025 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP1P59025 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTP1P59025 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTP1P59025 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTP1P59025 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP1P59025 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP1P59025 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP1P59025 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP1P59025 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP1P59025 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP1P59025 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP1P59025 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP1P59025 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP1P59025 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP1P59025 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms