Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME2P22392 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME2P22392 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME2P22392 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME2P22392 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME2P22392 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NME2P22392 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME2P22392 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NME2P22392 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NME2P22392 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME2P22392 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME2P22392 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME2P22392 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME2P22392 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME2P22392 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME2P22392 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NME2P22392 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME2P22392 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME2P22392 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME2P22392 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME2P22392 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME2P22392 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME2P22392 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME2P22392 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME2P22392 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NME2P22392 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NME2P22392 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NME2P22392 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NME2P22392 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME2P22392 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME2P22392 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME2P22392 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME2P22392 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME2P22392 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME2P22392 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NME2P22392 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME2P22392 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME2P22392 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NME2P22392 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME2P22392 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME2P22392 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME2P22392 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME2P22392 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME2P22392 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NME2P22392 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME2P22392 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms