Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI4P10075 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI4P10075 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI4P10075 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GLI4P10075 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI4P10075 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI4P10075 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI4P10075 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI4P10075 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI4P10075 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI4P10075 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI4P10075 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI4P10075 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI4P10075 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI4P10075 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI4P10075 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI4P10075 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI4P10075 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI4P10075 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI4P10075 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI4P10075 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLI4P10075 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI4P10075 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI4P10075 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI4P10075 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI4P10075 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI4P10075 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI4P10075 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLI4P10075 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GLI4P10075 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GLI4P10075 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GLI4P10075 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GLI4P10075 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GLI4P10075 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GLI4P10075 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GLI4P10075 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GLI4P10075 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GLI4P10075 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GLI4P10075 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GLI4P10075 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms