Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSO75390 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSO75390 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSO75390 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSO75390 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSO75390 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSO75390 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSO75390 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSO75390 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSO75390 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSO75390 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSO75390 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSO75390 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSO75390 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSO75390 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSO75390 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSO75390 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSO75390 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSO75390 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CSO75390 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSO75390 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSO75390 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSO75390 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSO75390 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSO75390 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSO75390 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSO75390 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSO75390 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSO75390 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSO75390 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSO75390 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSO75390 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSO75390 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSO75390 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSO75390 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSO75390 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSO75390 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSO75390 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSO75390 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSO75390 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSO75390 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSO75390 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSO75390 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSO75390 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSO75390 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSO75390 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSO75390 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSO75390 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSO75390 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSO75390 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSO75390 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSO75390 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSO75390 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSO75390 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSO75390 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSO75390 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSO75390 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSO75390 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSO75390 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSO75390 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSO75390 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSO75390 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms