Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC27A2O14975 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A2O14975 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms