Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXN3O00409 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXN3O00409 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms