Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms