Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU3Q9UQ49 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms