Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCOR1Q9UKL0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCOR1Q9UKL0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCOR1Q9UKL0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RCOR1Q9UKL0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCOR1Q9UKL0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCOR1Q9UKL0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCOR1Q9UKL0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCOR1Q9UKL0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms