Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TNIKQ9UKE5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC37.01■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TNIKQ9UKE5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms