Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms