Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG2Q9UBF2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms