Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7L3BQ96GX2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7L3BQ96GX2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7L3BQ96GX2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7L3BQ96GX2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7L3BQ96GX2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7L3BQ96GX2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN7L3BQ96GX2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN7L3BQ96GX2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN7L3BQ96GX2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN7L3BQ96GX2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms