Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms