Protein–RNA interactions for Protein: Q93052

LPP, Lipoma-preferred partner, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPPQ93052 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPPQ93052 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPPQ93052 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LPPQ93052 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPPQ93052 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPPQ93052 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPPQ93052 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPPQ93052 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LPPQ93052 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPPQ93052 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPPQ93052 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LPPQ93052 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPPQ93052 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPPQ93052 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPPQ93052 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPPQ93052 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPPQ93052 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPPQ93052 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LPPQ93052 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPPQ93052 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPPQ93052 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPPQ93052 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPPQ93052 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPPQ93052 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPPQ93052 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPPQ93052 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPPQ93052 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LPPQ93052 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPPQ93052 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPPQ93052 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPPQ93052 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPPQ93052 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPPQ93052 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPPQ93052 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPPQ93052 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPPQ93052 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LPPQ93052 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LPPQ93052 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LPPQ93052 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LPPQ93052 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPPQ93052 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPPQ93052 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPPQ93052 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPPQ93052 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPPQ93052 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPPQ93052 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPPQ93052 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LPPQ93052 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPPQ93052 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPPQ93052 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPPQ93052 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPPQ93052 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPPQ93052 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPPQ93052 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPPQ93052 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPPQ93052 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPPQ93052 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPPQ93052 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPPQ93052 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPPQ93052 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPPQ93052 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPPQ93052 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPPQ93052 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPPQ93052 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPPQ93052 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPPQ93052 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPPQ93052 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPPQ93052 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPPQ93052 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPPQ93052 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPPQ93052 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPPQ93052 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPPQ93052 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPPQ93052 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPPQ93052 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPPQ93052 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPPQ93052 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPPQ93052 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPPQ93052 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPPQ93052 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPPQ93052 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPPQ93052 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPPQ93052 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPPQ93052 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPPQ93052 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPPQ93052 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPPQ93052 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPPQ93052 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPPQ93052 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LPPQ93052 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPPQ93052 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPPQ93052 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPPQ93052 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPPQ93052 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPPQ93052 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LPPQ93052 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPPQ93052 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPPQ93052 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPPQ93052 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPPQ93052 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms