Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms