Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A4Q6P5W5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms