Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CC2D1BQ5T0F9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CC2D1BQ5T0F9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms