Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT3Q5FWE3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT3Q5FWE3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT3Q5FWE3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRRT3Q5FWE3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms