Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A3Q16572 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A3Q16572 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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