Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD1Q15797 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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