Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTDSPL2Q05D32 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms