Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD1Q02809 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms