Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MAP3K9P80192 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K9P80192 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms