Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF3P78545 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF3P78545 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF3P78545 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF3P78545 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF3P78545 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF3P78545 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELF3P78545 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELF3P78545 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELF3P78545 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELF3P78545 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELF3P78545 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELF3P78545 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELF3P78545 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELF3P78545 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELF3P78545 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELF3P78545 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELF3P78545 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELF3P78545 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELF3P78545 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELF3P78545 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELF3P78545 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELF3P78545 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELF3P78545 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELF3P78545 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELF3P78545 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELF3P78545 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELF3P78545 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELF3P78545 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELF3P78545 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELF3P78545 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELF3P78545 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELF3P78545 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELF3P78545 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELF3P78545 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELF3P78545 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ELF3P78545 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ELF3P78545 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ELF3P78545 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ELF3P78545 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ELF3P78545 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ELF3P78545 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ELF3P78545 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ELF3P78545 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ELF3P78545 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ELF3P78545 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELF3P78545 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELF3P78545 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELF3P78545 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELF3P78545 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELF3P78545 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELF3P78545 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELF3P78545 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELF3P78545 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF3P78545 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF3P78545 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms