Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms