Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M2P53677 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms