Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP2P42575 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP2P42575 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP2P42575 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP2P42575 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP2P42575 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP2P42575 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP2P42575 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP2P42575 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP2P42575 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP2P42575 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP2P42575 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP2P42575 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP2P42575 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP2P42575 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP2P42575 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP2P42575 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP2P42575 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP2P42575 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP2P42575 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP2P42575 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP2P42575 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP2P42575 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP2P42575 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP2P42575 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP2P42575 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP2P42575 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP2P42575 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP2P42575 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP2P42575 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP2P42575 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP2P42575 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP2P42575 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP2P42575 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP2P42575 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP2P42575 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP2P42575 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP2P42575 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP2P42575 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP2P42575 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP2P42575 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP2P42575 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP2P42575 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP2P42575 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP2P42575 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP2P42575 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP2P42575 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP2P42575 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP2P42575 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP2P42575 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP2P42575 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP2P42575 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP2P42575 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP2P42575 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP2P42575 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP2P42575 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP2P42575 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP2P42575 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP2P42575 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP2P42575 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP2P42575 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP2P42575 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP2P42575 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP2P42575 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP2P42575 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP2P42575 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP2P42575 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP2P42575 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP2P42575 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP2P42575 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP2P42575 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms