Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT2P35908 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT2P35908 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT2P35908 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT2P35908 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT2P35908 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT2P35908 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT2P35908 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT2P35908 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT2P35908 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT2P35908 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT2P35908 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT2P35908 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT2P35908 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT2P35908 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT2P35908 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT2P35908 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT2P35908 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT2P35908 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT2P35908 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT2P35908 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT2P35908 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT2P35908 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT2P35908 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT2P35908 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT2P35908 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT2P35908 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT2P35908 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT2P35908 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT2P35908 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT2P35908 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT2P35908 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT2P35908 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT2P35908 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT2P35908 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT2P35908 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT2P35908 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT2P35908 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT2P35908 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT2P35908 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT2P35908 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT2P35908 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT2P35908 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT2P35908 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT2P35908 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT2P35908 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT2P35908 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT2P35908 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT2P35908 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT2P35908 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT2P35908 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT2P35908 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT2P35908 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT2P35908 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT2P35908 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT2P35908 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT2P35908 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT2P35908 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT2P35908 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT2P35908 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT2P35908 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT2P35908 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT2P35908 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT2P35908 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT2P35908 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.9 ms