Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00869P0C866 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms