Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFLP07196 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFLP07196 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFLP07196 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFLP07196 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFLP07196 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFLP07196 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFLP07196 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFLP07196 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFLP07196 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFLP07196 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFLP07196 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFLP07196 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFLP07196 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFLP07196 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFLP07196 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFLP07196 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NEFLP07196 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NEFLP07196 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NEFLP07196 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NEFLP07196 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFLP07196 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFLP07196 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFLP07196 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFLP07196 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFLP07196 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFLP07196 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFLP07196 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFLP07196 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFLP07196 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFLP07196 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFLP07196 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFLP07196 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFLP07196 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFLP07196 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFLP07196 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFLP07196 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFLP07196 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFLP07196 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFLP07196 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFLP07196 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFLP07196 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFLP07196 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFLP07196 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFLP07196 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFLP07196 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFLP07196 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFLP07196 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFLP07196 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFLP07196 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFLP07196 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFLP07196 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFLP07196 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFLP07196 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFLP07196 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFLP07196 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFLP07196 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFLP07196 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFLP07196 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFLP07196 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFLP07196 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFLP07196 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFLP07196 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEFLP07196 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEFLP07196 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEFLP07196 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFLP07196 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFLP07196 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFLP07196 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFLP07196 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFLP07196 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFLP07196 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFLP07196 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFLP07196 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFLP07196 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFLP07196 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFLP07196 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFLP07196 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFLP07196 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFLP07196 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFLP07196 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFLP07196 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFLP07196 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFLP07196 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFLP07196 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFLP07196 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFLP07196 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFLP07196 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms