Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HLA-DOAP06340 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DOAP06340 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms