Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms