Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM4AO75164 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms