Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms