Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms