Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRNDQ9UKY0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRNDQ9UKY0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRNDQ9UKY0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRNDQ9UKY0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms