Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms