Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RBM42Q9BTD8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RBM42Q9BTD8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms