Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM8

ACSF2, Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF2Q96CM8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF2Q96CM8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF2Q96CM8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSF2Q96CM8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSF2Q96CM8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSF2Q96CM8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSF2Q96CM8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSF2Q96CM8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSF2Q96CM8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSF2Q96CM8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSF2Q96CM8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSF2Q96CM8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSF2Q96CM8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSF2Q96CM8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms