Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
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